기관시스템공학과의 교육목적을 달성하기 위하여 열유체공학 전공, 전기제어공학 전공, 응용역학·재료공학 전공을 설치 운영하여 선박의 주기관, 보조기관과 관련 전기제어시스템의 종합적 분야에 대하여 교육, 연구, 개발하고 해사 산업분야에서 요구하는 고급인력을 양성한다.