해사대학

• 항해학부
• 해상운송학부
• 항해정보시스템학부
• 기관시스템공학부
• 해양경찰학부
• 해양메카트로닉스학부
• 해군사관학부

해양공과대학

• 컴퓨터공학과
• 조선해양공학과
• 환경·생명공학과
• 해양건설공학과
• 해양스포츠·레저융합학과

해양산업융합학과

• 해양산업융합학과

첨단해양모빌리티학과

• 첨단해양모빌리티학과

교양과정부

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승선실습과정부

• 승선실습과정부

일반대학원

• 해상운송시스템학과
• 기관시스템공학과
• 해양경찰학과
• 해양전자·통신·컴퓨터공학과
• 해양시스템공학과

해양산업대학원

• 해상운송시스템학과
• 기관시스템공학과
• 해양경찰학과
• 해양전자·통신공학과
• 해양시스템공학과

대학본부

• 교무처
• 입학학생처
• 기획조정처
• 사무국
• 취업실습본부
• 국제교류본부
• GPS교육혁신본부

직속기구

• LINC3.0사업단
• 창업지원단
• 인권센터
• 해양에너지사업단
• 친환경스마트선박육성사업단

위원회

• 교수회
• 교무회
• 대학평의원회
• 교수평의회
• 등록금심의위원회
• 예산조정위원회
• 재정위원회

교육기본시설

• 도서관
• 정보전산원
• 체육관
• 학생회관

지원시설

• 승선생활관
• 공대생활관
• 마린시뮬레이션센터
• 기관공장

부속시설

• 박물관
• 학생상담센터
• 학생군사교육단
• 평생교육원
• 실습선
• 해양레포츠센터
• 교원양성지원센터
• 지역소통센터
• 현장실습지원센터

기타기구

• 장애학생지원센터
• 발전기금재단
• 대학언론사

연구시설

• 해양산업연구소
• 기계전자기술연구소

산학협력단

• 중소기업산학협력센터
• 국립목포해양대학교산학협력단 요트조종면허시험장
• 녹색해양기자재사업단
• 해상교통안전진단사업단
• 국제해사연구사업단
• 해운항만물류전문
  인력양성사업단
• 전남SeaGrant센터
• 선박수리지원센터
• 해양레저산업취업맞춤형 융합창의인력양성사업단

• 바다세미(사이버홍보단)
• 총동창회
• 재경동창회